Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubash3bQ8BGG7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms