Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms