Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhot1Q8BG51 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhot1Q8BG51 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhot1Q8BG51 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhot1Q8BG51 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhot1Q8BG51 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rhot1Q8BG51 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms