Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctdspl2Q8BG15 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdspl2Q8BG15 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctdspl2Q8BG15 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms