Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Jmjd4Q8BFT6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Jmjd4Q8BFT6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms