Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M10.5Q85ZW7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M10.5Q85ZW7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M10.5Q85ZW7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M10.5Q85ZW7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
H2-M10.5Q85ZW7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-M10.5Q85ZW7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M10.5Q85ZW7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms