Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg4cQ811C2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms