Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrsam1Q80ZI6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrsam1Q80ZI6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms