Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stkld1Q80YS9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stkld1Q80YS9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stkld1Q80YS9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.9 ms