Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp8Q80YR6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp8Q80YR6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms