Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Crb2Q80YA8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb2Q80YA8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb2Q80YA8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms