Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed4Q80WQ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbed4Q80WQ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms