Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcsk9Q80W65 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcsk9Q80W65 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcsk9Q80W65 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms