Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc1Q80VQ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc1Q80VQ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc1Q80VQ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc1Q80VQ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc1Q80VQ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc1Q80VQ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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