Protein–RNA interactions for Protein: Q80V63

Prdm4, PR domain zinc finger protein 4, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm4Q80V63 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm4Q80V63 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm4Q80V63 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm4Q80V63 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm4Q80V63 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm4Q80V63 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm4Q80V63 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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