Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2eQ80UW8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2eQ80UW8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms