Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnf1Q7TSH7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnf1Q7TSH7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms