Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1bQ7TSF1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms