Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1cQ7TSF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1cQ7TSF0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms