Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RgmbQ7TQ33 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RgmbQ7TQ33 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms