Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNV8

Defb34, Beta-defensin 34, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb34Q7TNV8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Defb34Q7TNV8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defb34Q7TNV8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb34Q7TNV8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb34Q7TNV8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb34Q7TNV8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb34Q7TNV8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb34Q7TNV8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms