Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HhipQ7TN16 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HhipQ7TN16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms