Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shq1Q7TMX5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Shq1Q7TMX5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Shq1Q7TMX5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Shq1Q7TMX5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
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