Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sys1Q78S06 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms