Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eci3Q78JN3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eci3Q78JN3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eci3Q78JN3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eci3Q78JN3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eci3Q78JN3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Eci3Q78JN3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Eci3Q78JN3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eci3Q78JN3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eci3Q78JN3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms