Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mvb12aQ78HU3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mvb12aQ78HU3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.5 ms