Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssh1Q76I79 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssh1Q76I79 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms