Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nme8Q715T0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nme8Q715T0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms