Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sned1Q70E20 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sned1Q70E20 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sned1Q70E20 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms