Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpv1Q704Y3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpv1Q704Y3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv1Q704Y3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms