Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NinlQ6ZQ12 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NinlQ6ZQ12 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
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