Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zc3h4Q6ZPZ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h4Q6ZPZ3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms