Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf653Q6YND2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf653Q6YND2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Znf653Q6YND2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Znf653Q6YND2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms