Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcl3Q6W5C0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl3Q6W5C0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms