Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ift172Q6VH22 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ift172Q6VH22 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms