Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATRAIDQ6UW56 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms