Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clca4aQ6Q473 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca4aQ6Q473 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms