Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms