Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc57Q6PHN1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc57Q6PHN1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms