Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmeff1Q6PFE7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmeff1Q6PFE7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmeff1Q6PFE7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms