Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc36Q6PDM4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc36Q6PDM4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms