Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SvoplQ6PDF3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms