Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc117Q6PB51 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc117Q6PB51 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc117Q6PB51 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc117Q6PB51 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc117Q6PB51 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc117Q6PB51 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc117Q6PB51 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc117Q6PB51 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms