Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB44

Ptpn23, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23, mousemouse

Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn23Q6PB44 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ptpn23Q6PB44 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptpn23Q6PB44 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ptpn23Q6PB44 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms