Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc148Q6P5U8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc148Q6P5U8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc148Q6P5U8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms