Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg2aQ6P4T0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms