Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsig8Q6P3A4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsig8Q6P3A4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms