Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Nsd3Q6P2L6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nsd3Q6P2L6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nsd3Q6P2L6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 299.6 ms