Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc189Q6NZQ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms