Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23ipQ6NZC7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23ipQ6NZC7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms